墨西哥时间2017年6月9日，墨西哥联邦经济竞争委员会（The Federal Economic Competition Commission of Mexico, FECC）宣布，包括商船三井在内的几家航运公司违反了墨西哥有关滚装运输服务的反垄断法，并予以相应惩罚。
商船三井及其他船公司因涉嫌违法发垄断法，遭到墨西哥联邦经济竞争委员会调查。在调查期间，商船三井密切配合墨西哥联邦经济委员会的调查。
尽管墨西哥联邦经济竞争委员会表示，这些公司承认违反墨西哥反垄断法，并处以5.81亿墨西哥比索（约合34.6亿日元）的惩罚。但是根据墨西哥条例，除以1.12亿墨西哥元（约合6.68亿日元，即3200万美元）作为名义上的惩罚外，商船三井及旗下子公司在内，免除一切惩罚。因为商船三井在墨西哥联邦经济竞争委员会正式调查之前终止了上述违法行为，且前者根据该委员会的豁免制度申请了豁免，并得到后者认可。